Вообщем написал небольшой скрипт который работает через консоль прямо в админке:

<?php
$oldCategoryId = 21951; // ID исходной категории
$newCategoryId = 21953; // ID целевой категории

// Проверяем существование новой категории
$newCategory = $modx->getObject('modResource', $newCategoryId);
if (!$newCategory) {
    echo "Ошибка: Категория с ID {$newCategoryId} не найдена!";
    return;
}

$count = 0;
$criteria = array(
    'class_key' => 'msProduct',
    'parent' => $oldCategoryId
);

foreach ($modx->getIterator('modResource', $criteria) as $product) {
    $product->set('parent', $newCategoryId);
    
    if ($product->save()) {
        $count++;
    } else {
        echo "Ошибка при сохранении товара ID {$product->id}<br>";
    }
}

echo "Успешно перемещено {$count} товаров.";
?>

Вауля - и ой как хорошо, наши товары перенеслись в другую категорию!
Не забудьте только почистить кэш и скинуть url в настройках.